Innenparasiten sind Schmarotzer, die im Inneren anderer Organismen leben und sich einseitig auf Kosten des Wirts ernähren, wodurch dieser geschwächt und krankheitsanfälliger wird. Bedeutsame Gruppen sind Saugwürmer wie der Große und Kleine Leberegel, Bandwürmer wie der Fuchsbandwurm sowie Trichinen und der Erreger der Toxoplasmose. Befall fällt meist erst beim Aufbruch auf, etwa durch Egel in der Leber oder verdickte Gallengänge. Trichinen sind beim Schwarzwild über die Trichinenschau nachzuweisen.